ポリハイドロキシエチルAカラムは、ポリエルシー社が親水クロマトグラフィ用として、特別に開発した中性で親水性の担体ですが、この担体を有機溶媒濃度が30％以下の移動相で使用すると、ペプチドやその他低分子量物質がゲル濾過分離モードとして利用できます。しかも移動相溶媒を単に変えるだけで、二つの異なる分子量分画範囲で使用することができます（下図22．参照）。
通常の塩バッファー系の移動相で、ポリハイドロキシエチルAカラムを使用しますと、分子量分画範囲は充填されている樹脂の孔径によって決定されます。その際ポリペプチドに対する非特異的吸着は、他社のゲル濾過カラムと比較して低いです。
一方、変性溶媒（例、50mMぎ酸及び、HFIPなど）を含有する移動相で、ポリハイドロキシエチルAカラムを使用しますと、シリカゲルに被覆してあるポリペプチドのペプチド鎖間の水素結合が可逆的に切れ、このペプチド鎖とペプチド鎖の間で、分子ふるいが行われるようになります（下図21．参照）。